Pirates of Black Cove: “Origins” se déroule à l'époque précédant la fondation de la faction Black Cove. Prenez le rôle du légendaire capitaine Grog - le pirate qui se rebella contre la perte de ses plus beaux vaisseaux au profit des clans de pirates unifiés.

En sous nombre face à l'union des pirates, le Captain Grog décide de planter les graines de la discorde parmi les clans de pirates pour les faire se battre entre eux. Après la séparation de l'alliance pirate et sa nouvelle union avec les forces de l'île perdu, il forme une nouvelle faction – les Black Covians.